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生物脱硫技术包括生物过滤、生物吸附和生物滴滤。这三个系统都是开放系统，它们的微生物种群随着环境的变化而变化。在生物脱硫过程中，氧化的硫污染物必须被还原为硫化物或H2S，然后被氧化为元素硫才能被去除。在大多数生物反应器中，微生物种类主要是细菌，其次是真菌，很少有酵母。常用的细菌包括氧化亚铁硫杆菌、脱氮硫杆菌和硫杆菌。最成功的代表是氧化亚铁硫杆菌，其生长最好。
当厌氧发酵装置产生沼气时，特别是在中高温发酵中，沼气携带大量H2S。由于沼气中仍有大量水蒸气，沼气中的水和H2S的共同作用加速了金属管道、阀门和流量计的腐蚀和堵塞。此外，H2S燃烧后产生的SO2与燃烧产物中的水蒸气结合形成亚硫酸盐，会对设备金属表面造成腐蚀，也会对大气环境造成污染，影响人体健康[4-6]。因此，在使用沼气之前必须去除H2S。
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