1、需要准备发酵床垫料，垫料可选用锯末、稻壳（如果物料不好找，打碎的秸秆或棉花杆也可以替代）。面积20平米的养猪发酵床需锯末10立方，锯末应选择原木而不是人造板材的下脚料。使用前需要去掉其中大的渣滓，晒干后备用。
2、稀释发酵床菌种，准备干撒式发酵床养猪菌种，将发酵床菌种（1千克装）按1:5比例与米糠或玉米粉或麸皮混匀稀释（不可加水），稀释为的是让发酵床菌种能够更均匀的与垫料混合，无其他目的。一千克装的发酵床菌种可以制作10-15个平方米的发酵床。
3、播撒发酵床菌种，铺洒方式有两种。可以将发酵床菌种与垫料事先混合均匀，直接将垫料铺到圈舍中；铺设10厘米的垫料，撒一层菌种，边铺边洒。
4、铺充足的垫料，一般养猪等大型动物铺设50厘米左右，鸡鸭等动物铺设40厘米左右。若锯末不足采用其他物料代替，建议表面20-30厘米仍然使用锯末。
5、放入动物，铺设好了发酵床就可以立即养动物了，无需等待。随着动物饲养过程中的粪尿排泄，发酵床就会启动。如果感觉刚放入动物容易起灰尘的话，可以略微喷施一点水。